發芽的馬鈴薯是整顆銷毀丟棄，不會使用。

（1）加工用馬鈴薯要輸入台灣之前，都須符合檢疫證明、並噴灑發芽抑制劑，有一定檢疫標準之後才能上船進口。

（2）但如果進入台灣海關之後，仍有發現產品在運送過程中出現部分腐爛、發芽的情況，就要進行特殊處置，送往加工場所剔除，並不是直接做加工使用。

（3）「台美對等貿易協定」（ART）協議過程中，台美雙方討論時，檢疫證明也都要經過我方認可，符合我們的標準才可以，如果整批產品腐爛、發芽等情況過於嚴重，我方仍可採取全批退回方式處理，僅部分異狀不需整批退回。

農業部也有相關闢謠說明：發芽馬鈴薯不會進入市場 ，檢疫階段發現就整顆銷毀丟棄！輸出前，美方就要確認馬鈴薯沒有附帶病蟲害、土壤、發芽，合格後才能輸出。只有安全、合格的馬鈴薯，才會進到後端的加工流程。（資料：Mygopen 2026/4/20）

加工廠在末端的汰選一直以來就是把關的一環，就像你買一盒草莓回家，洗草莓時發現有一顆爛掉，你會把爛掉的撿起來丟掉，而不是繼續放著讓家人吃一樣。把有問題的馬鈴薯若做成加工製品，萬一有人吃了發生什麼事，廠商賠上的是整個品牌，哪個廠商會為了省下幾顆爛馬鈴薯的錢，而拿自己的品牌冒險？

根據台灣事實查核中心的查核報告：中興大學食品安全研究所助理教授林信堂指出，以前馬鈴薯通關，「不代表整批沒有發芽個體」，只是幸運沒有被抽檢到，等到了加工廠，還是要由業者汰除發芽等無法加工的馬鈴薯。目前規定由加工廠負責汰選，實務上過去就是這麼做。關鍵的把關機制是在加工廠，政府應強化工廠稽查，才能消除民眾疑慮。