多篇論文顯示吸入二氧化氯可能會引起眼睛、鼻子、喉嚨及呼吸道黏膜的刺激，漂白水雖然殺菌、抗病毒效果最佳，但相對的漂白水刺激性也較高！即使是稀釋後一樣可能刺激人體皮膚及黏膜，故不建議做為手部清潔替代品使用，只能用於環境消毒、清潔。漂白水稀釋前後都有一定的揮發和刺激性，民眾在稀釋、使用時一定要配戴口罩和手套，防止對皮膚及呼吸道黏膜造刺激；並保持環境的通風，預防因吸入過多揮發氣體而造成頭暈、嘔吐不適感。同時不要跟酸、氨、胺類成分混合，以免產生有害物質。